De acordo com o meio que os suporta, os ecossistemas podem ser de vários tipos, podendo ser classificados em:

Ecossistemas terrestres - em que o elemento de suporte é o solo. Dependem da luz, da temperatura e da humidade;

Ecossistemas aquáticos -que têm como elemento de suporte a água. Dependem da temperatura, da salinidade, das correntes e marés. Podem ser marinhos ou de água doce.

Em relação ao meio aéreo, não existem ecossistemas totalmente suportados pelo ar, pelo que normalmente não se considera a existência de ecossistemas aéreos.

(http://www.naturlink.pt/canais/Artigo.asp?iArtigo=117&iCanal=1&iSubCanal=11111&iLingua=1)