O Biodiesel pode ser usado puro ou em mistura com o óleo diesel em qualquer proporção. Tem aplicação singular quando utilizado em mistura com o óleo diesel de ultra baixo teor de enxofre, porque confere a este, melhores características de lubricidade. O uso dos ésteres em adição de 5 a 8% é visto como uma alternativa excelente para reconstituir essa mesma lubricidade.

Mundialmente passou-se a adoptar uma nomenclatura bastante apropriada para identificar a concentração do Biodiesel na mistura. É o Biodiesel BXX, onde XX é a percentagem em volume do Biodiesel à mistura. Por exemplo, o B2, B5, B20 e B100 são combustíveis com uma concentração de 2%, 5%, 20% e 100% de Biodiesel, respectivamente.

(http://www.pme.online.pt/fotos/noticias/BIODIESEL.pdf)

(...) foi efectuada a caracterização de misturas do biodiesel com o diesel fóssil: (...) biodiesel de 5% (B5), 10% (B10), 20% (B20) e 40% (B40). Para tal, foi utilizada a amostra de biodiesel BD-24 e um gasóleo comercialmente disponível.

(http://www.netresiduos.com/cir/relatorios/RelaEstaBiodiesel.pdf)