A construção de novas barragens vai completamente contra as exigências da Directiva-Quadro da Água em termos de qualidade da água, que exige não só evitar a degradação mas também melhorar o estado dos ecossistemas. Todas as barragens seleccionadas localizam-se em troços lóticos considerados em risco de não cumprirem os objectivos ambientais da Directiva, o que será agravado com a construção de barragens. (...)

É também notório que apenas alguns grupos faunísticos contribuem para os critérios de avaliação do impacto na biodiversidade, situação que deve ser corrigida. São necessários novos critérios e mais e melhor informação. Veja-se o caso das aves as quais, nomeadamente as aves rupícolas, dependentes de alguns dos habitats que serão afectados por estas infra-estruturas, não são contempladas. Há também que referir que o impacte não se pode apenas referir a nidificação mas também à utilização destes espaços como locais de alimentação. Por exemplo a barragem de Alvito poderá ter impactes negativos nas populações de cegonha-negra que nidificam e se alimentam neste vale do rio Ocreza (11 casais com 10 % da população nacional).

Apesar da falta de informação fica claro que de modo geral todas elas criam graves problemas ao nível da ictiofauna (muitas das nossas espécies de água-doce têm um estatuto de conservação que exige mais medidas de conservação), criando ou acentuando a fragmentação do meio lótico, situação especialmente grave para os peixes migradores.

É também notório o impacte sobre outras espécies com estatuto de conservação como a toupeira-de-água, endemismo ibérico com estatuto de vulnerável (que poderá ver agravado este estatuto face à instalação destas infra-estruturas), presente nas barragens das bacias do Tâmega, Mondego e Vouga. Outras espécies de flora e fauna verão acentuada a fragmentação do seu habitat e haverá quebra nalguns corredores ecológicos (comunidades florísticas de leitos de cheia e vertebrados terrestres entre outros).

(http://www.quercus.pt/scid/webquercus/defaultArticleViewOne.asp?categoryID=567&articleID=2214)